Im Tunnel des Eupalinos befindet sich eine Wasserleitung, die im 6. Jahrhundert zur Versorgung der griechischen Stadt Samog (heute Pythagorio) errichtet wurde. Diese Leitung wurde nach dem Architekten Eupalinos von Megara benannt. Als Bauherr wurde er Tyrann Polykrates Samos genannt und er stellte die 1036m lange Wasserleitung zwischen 550 und 530 v. Chr. fertig. Beim Bau wendete er wahrscheinlich die pythagoreische Geometrie an. Dieser Leitung war mehr als 1000 Jahre im Betrieb und auch der längste Tunnel seiner Zeit. Jedoch wurde der Tunnel mit der Wasserleitung im 7. Jahrhundert n. Chr. vernachlässigt und schließlich ganz aufgegeben. 1882 wurde der Tunnel von einem einheimischen Abt wiederentdeckt, der sich auf Texte des Herodot, einem antiken Schriftstellers, stützte.

Daraufhin untersuchten verschiedene Forscher dieses Werkt, doch jeder gab nach einer kurzen Zeit auf. Da er 180m tief unter einem Berg gegraben wurde. Erst 1995 veröffentlichte der Bauforscher Hermann Kienast die bislang detaillierteste Untersuchung der Gesamtanlage.

Ein 900m langer Abschnitt lag außerhalb der Stadtmauer. Hier befindet sich eine unterirdische Leitung von der Quelle bis zum nördlichen Abhang des Berges. Ab hier folgt die 1036m lange Leitung und verläuft in die unterirdische 500m lange Leitung bis zu einem Brunnenhaus der sich innerhalb der Stadtmaue befand. Heute in 180m tiefe sind 150m der Leitung für Touristen begehbar. Die können sich die Ausarbeitungen von früher mit bloßem Gestein ansehen.